Перенос эмбрионов (ПЭ) осуществляется на 2-6-й день культивирования, в зависимости от особенностей ситуации. ПЭ проводится в основном с наполненным мочевым пузырем. Процедура переноса безболезненная, не требует проведения анестезии, хотя возможно ощущение легкого дискомфорта. Процедура не требует много времени, проходит в течение 10-15 минут. Присутствие супруга не является обязательным. В день переноса можно поесть. Перед ПЭ врач и супружеская пара решают вопрос о количестве переносимых эмбрионов. Обычно переносят 1-3 эмбриона, но следует учитывать, что увеличение количества переносимых эмбрионов увеличивает риск развития многоплодной беременности.
Процедуру проводят на гинекологическом кресле. Во влагалище врач вводит гинекологическое зеркало, обнажая шейку матки. Эмбриолог набирает необходимое количество эмбрионов в специальный стерильный катетер, напоминающий пластиковую соломинку, с присоединенным к нему шприцем и передает врачу. Врач вводит гибкий катетер через шейку матки, и эмбрионы переносятся с каплей питательной среды в полость матки. Далее эмбриолог под микроскопом проверяет, все ли эмбрионы вышли из катетера. Эмбрионы хорошего качества, оставшиеся у супружеской пары после ПЭ, можно заморозить с целью использования в дальнейших попытках ЭКО. После ПЭ можно некоторое время оставаться в горизонтальном положении.